Исчезновение Харухи Судзумии

Середина декабря приносит с собой предвкушение праздника, и неутомимая лидер бригады SOS, Судзумия Харухи, выдвигает новую идею: провести Рождество в своей штаб-квартире, устроив праздничный ужин для всего состава. Члены организации, хоть и не без привычного удивления, активно включаются в подготовку к необычному мероприятию, предвкушая очередное приключение по её прихоти.

Однако вскоре привычная реальность начинает давать трещины. По дороге в школу Кён сталкивается с первыми странностями: его друг Танигути, якобы договорившийся с ним накануне, внезапно заболел и ничего не помнит. В классе ситуация становится пугающей: место Харухи занимает ожившая Рёко Асакура, а Микуру Асахина смотрит на Кёна как на совершенно незнакомого человека.

Мир, кажется, переписан заново. Ни могущественная Нагато Юки, некогда хранительница космических данных, ни сама бригада SOS не существуют в этой новой реальности. Кён оказывается в одиночестве, пытаясь осмыслить исчезновение всего, что было ему дорого, и понять, как вернуть потерянное время и своих друзей.